More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04461 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04461  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
333 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1752  protoheme IX farnesyltransferase  80.25 
 
 
326 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  79.33 
 
 
333 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0610  protoheme IX farnesyltransferase  80.39 
 
 
327 aa  461  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.864627  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05101  protoheme IX farnesyltransferase  74.7 
 
 
332 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04721  protoheme IX farnesyltransferase  74.1 
 
 
333 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05031  protoheme IX farnesyltransferase  74.1 
 
 
333 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0447  protoheme IX farnesyltransferase  73.72 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1779  protoheme IX farnesyltransferase  74.92 
 
 
331 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05021  protoheme IX farnesyltransferase  75.54 
 
 
331 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.196285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.43 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  41.56 
 
 
318 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
323 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
323 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.32 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 
324 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  45.59 
 
 
276 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 
622 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.39 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.3 
 
 
321 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  44.66 
 
 
296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
317 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37.82 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  37.68 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  36.45 
 
 
315 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.05 
 
 
302 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.6 
 
 
312 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 
307 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 
478 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  35.36 
 
 
299 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  39.34 
 
 
317 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
318 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  36.99 
 
 
316 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  37.81 
 
 
299 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 
316 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 
308 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 
317 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  38.21 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  39.92 
 
 
317 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 
317 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  47.06 
 
 
302 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 
302 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 
301 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  37.41 
 
 
310 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.36 
 
 
295 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  41.25 
 
 
328 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 
316 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  40.38 
 
 
313 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 
296 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 
328 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 
304 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
443 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  38.19 
 
 
313 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  41.83 
 
 
303 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 
308 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  34.91 
 
 
345 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  37.66 
 
 
304 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  38.75 
 
 
310 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 
535 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.56 
 
 
302 aa  149  9e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  35.49 
 
 
304 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  38.85 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  35.79 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
317 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 
335 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 
326 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  38.93 
 
 
624 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 
304 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  37.93 
 
 
298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  39.54 
 
 
317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  42.79 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  36.15 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  38.1 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 
301 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 
341 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 
297 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  35.92 
 
 
298 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 
333 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 
333 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  36.15 
 
 
313 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 
297 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  39.75 
 
 
294 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  37.7 
 
 
342 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  40.64 
 
 
309 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>