More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05021 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_05021  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
331 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.196285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1779  protoheme IX farnesyltransferase  99.7 
 
 
331 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04461  protoheme IX farnesyltransferase  75.54 
 
 
333 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0610  protoheme IX farnesyltransferase  76.53 
 
 
327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.864627  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05101  protoheme IX farnesyltransferase  74.84 
 
 
332 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1752  protoheme IX farnesyltransferase  73.44 
 
 
326 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0447  protoheme IX farnesyltransferase  74.6 
 
 
333 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  73.09 
 
 
333 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05031  protoheme IX farnesyltransferase  75.33 
 
 
333 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04721  protoheme IX farnesyltransferase  75.66 
 
 
333 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.7 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  41.7 
 
 
318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  38.8 
 
 
323 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 
328 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.25 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  43.87 
 
 
276 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 
312 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 
622 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  39.15 
 
 
299 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  40.09 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 
316 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  41.48 
 
 
302 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  40.79 
 
 
307 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  39.29 
 
 
326 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 
299 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
304 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 
313 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 
316 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 
317 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 
295 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 
316 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 
313 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  35.59 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 
302 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  40.3 
 
 
302 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 
328 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  41.23 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.93 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  37.82 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 
302 aa  152  7e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  39.91 
 
 
308 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 
303 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  35.48 
 
 
317 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  38.35 
 
 
296 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
295 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  36.98 
 
 
317 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 
317 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  39.17 
 
 
333 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  36.98 
 
 
317 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  33.09 
 
 
345 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  39.17 
 
 
310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  39.17 
 
 
333 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 
325 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 
312 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 
310 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.73 
 
 
443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  34.14 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  35.84 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  41.71 
 
 
301 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  41.71 
 
 
301 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
328 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
328 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  41.71 
 
 
301 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 
478 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
326 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  35.15 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  35.44 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  34.36 
 
 
312 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  34.36 
 
 
315 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  39.41 
 
 
624 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 
303 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 
311 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  38.64 
 
 
317 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  38.27 
 
 
305 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 
300 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  34.41 
 
 
301 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  41.23 
 
 
301 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 
304 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  32.91 
 
 
316 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  34.03 
 
 
302 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 
317 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 
301 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  37.87 
 
 
301 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 
300 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 
300 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 
315 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 
305 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 
297 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>