More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2102 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  66.08 
 
 		 299 aa  339  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  39.16 
 
 		 622 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  39.19 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 317 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 534 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  37.18 
 
 		 624 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  37.14 
 
 		 535 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  38.59 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  39.94 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  38.08 
 
 		 306 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  39.24 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  39.31 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  36.49 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.69 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 443 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  35.44 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  37.62 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  36.66 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.54 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  37.3 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  38.52 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.63 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  35.81 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  36.08 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  36.99 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  35.19 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  37.41 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  36.22 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  35.89 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  33.55 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  37.36 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  35.99 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  35.93 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  35.31 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  36.48 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  38.7 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  37.14 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  35.59 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  35.59 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  36.79 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>