More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1168 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  75.27 
 
 		 286 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  54.17 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  44.48 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  46.58 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  46.58 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  46.58 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  45.55 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  48.77 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  37.93 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  43.25 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  43.94 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  42.81 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  44.18 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  44.41 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  43.06 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  43.34 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.47 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  38.46 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  42.36 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  39.5 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.89 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  38.91 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  50.96 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  49.05 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  36.78 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  45.78 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  44.25 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  42.67 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.79 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.7 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  40.51 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.85 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40.93 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40.85 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.08 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40.85 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  40.65 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.37 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  44.7 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.21 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  42.68 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  44.39 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.15 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.05 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.68 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  44.24 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.33 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  40.93 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.73 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.84 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  37.89 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.81 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  41.26 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.38 
 
 		 328 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.99 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  45.33 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.1 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  40 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.54 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  38.4 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  38.49 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.03 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  43.11 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.31 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  38.4 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.17 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.76 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.13 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  42.15 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  38.67 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  38.1 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.53 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.6 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.91 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  40.55 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>