More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5601 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  100 
 
 		 563 aa  1107    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  60.04 
 
 		 610 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  35.49 
 
 		 589 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  37.04 
 
 		 589 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  37.19 
 
 		 590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  36.8 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  36.73 
 
 		 593 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  37.13 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.31 
 
 		 593 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  35.9 
 
 		 950 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  36.43 
 
 		 606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  34.6 
 
 		 599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  35.54 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  37.37 
 
 		 593 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 		 608 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  34.37 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  33.68 
 
 		 593 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  36.44 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 594 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  34.31 
 
 		 954 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.33 
 
 		 648 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.65 
 
 		 663 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  35.96 
 
 		 951 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  37.16 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.92 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.73 
 
 		 609 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.21 
 
 		 594 aa  267  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  36.65 
 
 		 603 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  34.8 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  36.38 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  36.44 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.79 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  32.42 
 
 		 643 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  34.85 
 
 		 588 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.92 
 
 		 594 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.44 
 
 		 594 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 611 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  34.09 
 
 		 594 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  34.27 
 
 		 594 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  33.86 
 
 		 594 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  33.91 
 
 		 594 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.73 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  35.88 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  33.45 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  34.09 
 
 		 594 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.09 
 
 		 594 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.09 
 
 		 594 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  35.12 
 
 		 612 aa  256  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  36.63 
 
 		 597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.63 
 
 		 616 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  34.68 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.97 
 
 		 608 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  38.6 
 
 		 827 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  34.47 
 
 		 631 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  34.55 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  36.76 
 
 		 823 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.67 
 
 		 823 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  35.09 
 
 		 682 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.45 
 
 		 830 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  33.86 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.41 
 
 		 603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  34.64 
 
 		 595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  33.7 
 
 		 679 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  35.02 
 
 		 678 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.72 
 
 		 596 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  32.85 
 
 		 647 aa  243  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  34.14 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  34.62 
 
 		 832 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  33.8 
 
 		 583 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  33.91 
 
 		 624 aa  240  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  34.63 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  34.66 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.71 
 
 		 822 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  48.41 
 
 		 261 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  36.46 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  33.97 
 
 		 629 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  33.57 
 
 		 625 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  33.5 
 
 		 614 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  48.41 
 
 		 259 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.77 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  50 
 
 		 255 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  33.63 
 
 		 608 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  33.63 
 
 		 608 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.41 
 
 		 828 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  34.32 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  48.02 
 
 		 254 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  46.88 
 
 		 256 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  51.15 
 
 		 256 aa  219  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  45.38 
 
 		 258 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  44.8 
 
 		 252 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  45.38 
 
 		 258 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  45.38 
 
 		 258 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>