170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4336 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  58.2 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  54.58 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  55.19 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  52.28 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  50.62 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  54.36 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  51.22 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  49.79 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  50.68 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  46.47 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  47.2 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  44.03 
 
 		 423 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  38.63 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  41.95 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  40.49 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  43.2 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  40.7 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  37.96 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  41.38 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.04 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  35.34 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  34.89 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  34.89 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  35.79 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  35.26 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  35.79 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  35.16 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  33.78 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  32.91 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  31.2 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.65 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  32.65 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.54 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  35.75 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  38.15 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.42 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.21 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.44 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.41 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  29.19 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  39.22 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.19 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  35.34 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  25.42 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  32.89 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.8 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  40.35 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.5 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.5 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  31.47 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.98 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  31.22 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.5 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.17 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  32.41 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26.92 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  28.88 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.45 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.56 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.98 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  36.69 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.5 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  36.84 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  33.55 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.83 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  25.69 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.03 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.35 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.41 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  32.09 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  32.04 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  30.1 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  36.84 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  36.05 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  26.88 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  34.96 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.08 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.62 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  29.75 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  30.6 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.46 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.2 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  28.49 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  24.07 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.82 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.16 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>