More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2848 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2848  inner-membrane translocator  100 
 
 		 337 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.525645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  54.01 
 
 		 610 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0762  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0704  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0207782  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  31.72 
 
 		 628 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  33.46 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  30.72 
 
 		 594 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.11 
 
 		 656 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  33.74 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  28 
 
 		 632 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  27.06 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.36 
 
 		 852 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0432  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.15 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  27.06 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3185  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.24 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  31.01 
 
 		 597 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  28.01 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3477  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783038  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1504  urea ABC transporter, permease protein UrtC  26.57 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 637 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1287  urea ABC transporter, permease protein UrtC  26.73 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2272  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3732  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.89 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 407 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  25.4 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4008  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4264  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142913  hitchhiker  0.0000226311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4060  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0299219  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>