More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4264 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4264  inner-membrane translocator  100 
 
 		 331 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142913  hitchhiker  0.0000226311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0432  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  69.18 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0147  inner-membrane translocator  74.11 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0675175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.78 
 
 		 620 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  33.65 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  36.55 
 
 		 616 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  33.9 
 
 		 585 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  34.25 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.5 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  30.82 
 
 		 604 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.06 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  33.33 
 
 		 601 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.4 
 
 		 385 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.22 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.84 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.15 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.63 
 
 		 606 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.7 
 
 		 418 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  30.58 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0699  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  30.58 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.58 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1423  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  27.76 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3204  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.94 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.975304 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  30.28 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2159  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.63 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.708792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  26.11 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1086  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.13 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4450  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.8 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.46 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  26.86 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1971  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000553535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  30.64 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.66 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  29.7 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  26.11 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.03 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0992  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 356 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  25.8 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  29.39 
 
 		 615 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5757  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0702  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.36 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.67 
 
 		 852 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.97 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  30.13 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5581  urea ABC transporter permease UrtC  30.82 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  30.51 
 
 		 593 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  25.8 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2871  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.91 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00794762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1338  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  29.91 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2792  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  29.91 
 
 		 358 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2498  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.94 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0421862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  30.85 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0988  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.03 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  30.17 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64290  putative permease of ABC transporter  30.16 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>