More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1562 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  100 
 
 		 368 aa  708    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3204  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.81 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.975304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3018  inner-membrane translocator  47.11 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.322534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4290  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2665  inner-membrane translocator  45.97 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5757  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 356 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3320  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0807  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4450  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.65 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0351  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  34.53 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4189  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.51 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7016  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.44 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.23 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  30 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.33 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  31.17 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  33.14 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3700  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.74 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1796  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.1 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  29.85 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.28 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30 
 
 		 414 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3498  inner-membrane translocator  30.05 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.21 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4076  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.62 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  30.93 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1773  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2973  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.604364  normal  0.198493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  30.61 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.33 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.57 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  29.93 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.24 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  28.08 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  29 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.48 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3589  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.53 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  26.71 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0988  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  28.53 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  27.76 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3734  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1955  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4186  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4634  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5670  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.79 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.11 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.18 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.49 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2253  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.33 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2191  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.41 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  26.73 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.03 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29721  putative membrane protein of urea ABC transport system  31.07 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0566  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3316  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.63 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.852064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.9 
 
 		 620 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.33 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  28.62 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.64 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2776  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.04 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  28.33 
 
 		 585 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.19 
 
 		 393 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.7 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  28.66 
 
 		 585 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0228  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like  30.71 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.836611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.98 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1709  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.89 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0595  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.45 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>