More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3819 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0432  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.78 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4264  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142913  hitchhiker  0.0000226311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0147  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 360 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0675175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.59 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.57 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 359 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.92 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.27 
 
 		 620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.94 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.14 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  32.39 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  29.82 
 
 		 615 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.94 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.53 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.99 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 320 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.3 
 
 		 359 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2159  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.34 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.708792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  30.65 
 
 		 597 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.44 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 652 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  30.67 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  30.85 
 
 		 585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  27.98 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1423  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  29.75 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  30.42 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  30 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  32.88 
 
 		 616 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0699  inner-membrane translocator  30 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.68 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.61 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.31 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.66 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.94 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2498  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.34 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0421862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.3 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1086  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.21 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  30.99 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0190  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  30.84 
 
 		 594 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.18 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.75 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1955  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.65 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1504  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.13 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.25 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.75 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  29.34 
 
 		 583 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0500  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.89 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0771469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  30.1 
 
 		 604 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  33 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 646 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0954  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449226  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  29.69 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.97 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 632 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>