More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0432 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0432  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 357 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0147  inner-membrane translocator  83.89 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0675175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4264  inner-membrane translocator  69.18 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142913  hitchhiker  0.0000226311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  56.78 
 
 		 362 aa  328  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.78 
 
 		 620 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.48 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  35.86 
 
 		 616 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  30.15 
 
 		 597 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  32.18 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4450  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.59 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  32.53 
 
 		 585 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.1 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.02 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 359 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  27.99 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.92 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3204  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.17 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.975304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  32.48 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4908  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  30.77 
 
 		 593 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  29.31 
 
 		 604 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  30.31 
 
 		 593 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  25.51 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  31.35 
 
 		 601 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 652 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  30.91 
 
 		 838 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  28.62 
 
 		 615 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4290  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.84 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.04 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  27.64 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  28.84 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  26.76 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.77 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1504  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.69 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4060  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0299219  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.64 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4843  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.16 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.227032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4721  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131365  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.94 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.64 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.85 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  30.16 
 
 		 632 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.45 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  30.69 
 
 		 583 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.01 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0992  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.97 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  31.1 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2848  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.525645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  27.86 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.41 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>