More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5623 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
458 aa  959    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  82.75 
 
 
455 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  55 
 
 
462 aa  522  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  44.15 
 
 
451 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
435 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 
434 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 
448 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
448 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 
440 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 
457 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
436 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
421 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  31.07 
 
 
437 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 
436 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
471 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
427 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 
428 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
439 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
449 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
447 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
477 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
428 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
483 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
480 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
462 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
485 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  27.05 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
501 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
469 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
481 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 
459 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
451 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
490 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
447 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
464 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
446 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
499 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
473 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 
452 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
462 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  24.95 
 
 
435 aa  123  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
452 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
476 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
444 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
444 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 
403 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
487 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
356 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
406 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
463 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
468 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  22.47 
 
 
444 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 
432 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
358 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
459 aa  96.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.88 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
349 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.92 
 
 
347 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.59 
 
 
312 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.85 
 
 
359 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
359 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  23.22 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.65 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  24.1 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.62 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.62 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  25.22 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  25.26 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  25.26 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  32.5 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  32.5 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>