More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4241 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
331 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5352  transcriptional regulator, AraC family  52.89 
 
 
282 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20713  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  46.72 
 
 
279 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 
282 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 
290 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5271  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 
284 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0620952  normal  0.0372935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
279 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 
286 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  48.04 
 
 
282 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 
311 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 
299 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  31.55 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  37.14 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.3 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  35.58 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  35.58 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.58 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.58 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.58 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.58 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.58 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  28.88 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  34.62 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5575  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.229982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  34.17 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1558  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
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NC_009380  Strop_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
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NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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