209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1810 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
341 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  50.78 
 
 
328 aa  328  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  46.18 
 
 
340 aa  309  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  47.42 
 
 
337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  45.48 
 
 
325 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  30.88 
 
 
279 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  34.46 
 
 
266 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  25.22 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.72 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  27.33 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  26.32 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.36 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  22.85 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  31.05 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  23.6 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  27.88 
 
 
292 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  25.73 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  27.48 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.63 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  26.38 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  25.65 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  25.62 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.7 
 
 
275 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  29.17 
 
 
559 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  21.82 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  21.7 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  25 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  24.28 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.55 
 
 
515 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  24.24 
 
 
579 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  20.75 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  21.52 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  25.18 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  31.2 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  33.85 
 
 
150 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.11 
 
 
430 aa  59.3  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  26.86 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  24.69 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
150 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.57 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  26.07 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  30.2 
 
 
152 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  51.35 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  25.99 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  34.72 
 
 
154 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.22 
 
 
529 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.99 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  25.65 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.34 
 
 
152 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  27.76 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  28.86 
 
 
155 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  36.96 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.01 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  32.84 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3824  virulence factor Mce family protein  26.47 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.53 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.2 
 
 
523 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  24.08 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  31.36 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  32.09 
 
 
148 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  20.6 
 
 
339 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  22.15 
 
 
313 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  30.08 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  21.89 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  27.38 
 
 
295 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  41.89 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.51 
 
 
296 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  29.82 
 
 
343 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.18 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  28.99 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  25.81 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  23.99 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  26.06 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  25.76 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  25.76 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  28.67 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  25.65 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  27.88 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  25.42 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.93 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  31.93 
 
 
152 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  39.71 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  21.51 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  28.31 
 
 
390 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  26.03 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.93 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  29.85 
 
 
148 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>