283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1056 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 513 aa  1058    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.12 
 
 		 525 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  47.72 
 
 		 501 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  47.34 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  45.62 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  45.42 
 
 		 481 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  44.49 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  37.05 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  36.85 
 
 		 483 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  35.98 
 
 		 488 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  35.79 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  35.66 
 
 		 483 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  36.78 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  35.59 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  35.18 
 
 		 483 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.29 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  34.72 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  34.06 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  34.06 
 
 		 483 aa  276  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  34 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  33.6 
 
 		 481 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.11 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  28.88 
 
 		 378 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.42 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.95 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  26.76 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  25.89 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  27.18 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.03 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.65 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.56 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  25.48 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  30.13 
 
 		 386 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.08 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.3 
 
 		 387 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  29.57 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.57 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 		 386 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.72 
 
 		 386 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.07 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  25.75 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.75 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.78 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.75 
 
 		 493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  28.37 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.71 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.12 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  25.45 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  25.45 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.45 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  25.45 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  23.47 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  29.11 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  26.81 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  25.45 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.77 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.77 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.65 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  25.45 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  25.36 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  26.05 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  23 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.71 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  27.4 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.55 
 
 		 493 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.01 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  27.56 
 
 		 548 aa  113  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  23.2 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  26.41 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.46 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.57 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  24.46 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  26 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.46 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  25.4 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  24.51 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  24.51 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  24.27 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  24.27 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.46 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.42 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  25.13 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.98 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  24.18 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.25 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  24.53 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  24.53 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  24.27 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  23.99 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  24.95 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  26.19 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>