199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  59.91 
 
 		 266 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  53.81 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 253 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  42.05 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  42.4 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 253 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.06 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.02 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  30.06 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  25.41 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>