More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  70.32 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  70.49 
 
 		 335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  70.26 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  67.21 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  63.46 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  64.59 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  66.03 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  62.58 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  61.11 
 
 		 319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  57.95 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  60.46 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  55.27 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  59.08 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  54.07 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  58.55 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  41 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  39.2 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.36 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 		 340 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  35.64 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.04 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.8 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  36.15 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  23.38 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  22.37 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.97 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.75 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  26.42 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  24.26 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  24.24 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  22.95 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.91 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.57 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  28.29 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  24.52 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  23.45 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  29.46 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.58 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.11 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  23.47 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>