83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3049 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  783    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.34 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  30.05 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  26.5 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.38 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  24.25 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  30.64 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  24.67 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  26.25 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.35 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  25.32 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.67 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  25.1 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84561  Synaptic vesicle transporter SVOP  28 
 
 		 604 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.17 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.66 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  24.7 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.39 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.97 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.11 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  28.12 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  31.29 
 
 		 752 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 629 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  30.7 
 
 		 548 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 499 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.39 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  25.27 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>