More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1311 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  73.25 
 
 		 1025 aa  1477    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  70.84 
 
 		 1026 aa  1449    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  72.98 
 
 		 1022 aa  1481    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  73.18 
 
 		 1022 aa  1484    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.35 
 
 		 1029 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  73.08 
 
 		 1022 aa  1482    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1023 aa  2046    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.55 
 
 		 1039 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  76.01 
 
 		 1038 aa  1529    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.82 
 
 		 1048 aa  707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  74.05 
 
 		 1023 aa  1518    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  72.7 
 
 		 1022 aa  1446    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1037 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  72.35 
 
 		 1026 aa  1481    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  72.16 
 
 		 1026 aa  1478    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  74.41 
 
 		 1021 aa  1536    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  39.21 
 
 		 1049 aa  705    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  73.18 
 
 		 1022 aa  1485    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  80 
 
 		 1030 aa  1604    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  72.84 
 
 		 1026 aa  1488    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  79.27 
 
 		 1026 aa  1575    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.58 
 
 		 830 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1008 aa  439  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1019 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1020 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1014 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.69 
 
 		 1019 aa  361  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1019 aa  354  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1030 aa  353  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1035 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.91 
 
 		 1019 aa  353  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1019 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1012 aa  344  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.8 
 
 		 1027 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  28.07 
 
 		 1027 aa  342  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.6 
 
 		 1025 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.93 
 
 		 1010 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1021 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1021 aa  337  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1021 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1028 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  26.52 
 
 		 1025 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.59 
 
 		 1028 aa  336  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1009 aa  333  8e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.23 
 
 		 1025 aa  332  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1046 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1027 aa  330  9e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1021 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  27.26 
 
 		 1020 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1040 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1051 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1022 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1022 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1020 aa  328  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.86 
 
 		 1033 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1020 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1017 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1016 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1017 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1046 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  25.29 
 
 		 1022 aa  325  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1023 aa  324  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1024 aa  324  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1048 aa  324  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1013 aa  324  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1009 aa  323  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1029 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1035 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1053 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1029 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1050 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1029 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1035 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1048 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1049 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1021 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1017 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1049 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1029 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1026 aa  322  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1024 aa  321  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1029 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1029 aa  321  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1024 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1029 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  26.71 
 
 		 1015 aa  320  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1033 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  27.18 
 
 		 1036 aa  319  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.36 
 
 		 1032 aa  319  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1029 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1047 aa  319  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1027 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1046 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  24.85 
 
 		 1046 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1047 aa  318  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1023 aa  318  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1027 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  25.83 
 
 		 1024 aa  317  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  26.2 
 
 		 1024 aa  317  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>