More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2813 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  93.03 
 
 		 459 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  99.13 
 
 		 459 aa  958    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  79.87 
 
 		 467 aa  804    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  93.03 
 
 		 459 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  73.14 
 
 		 456 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  93.25 
 
 		 459 aa  914    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  73.36 
 
 		 456 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  93.46 
 
 		 459 aa  916    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  73.36 
 
 		 456 aa  692    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.58 
 
 		 455 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  99.35 
 
 		 459 aa  962    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  93.68 
 
 		 459 aa  919    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  98.91 
 
 		 459 aa  959    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  966    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  80.48 
 
 		 456 aa  791    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  53.05 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  54.76 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  45.57 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  45.09 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  42.48 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  45.28 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  46.65 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  40.93 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  40.38 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.42 
 
 		 495 aa  328  9e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  38.49 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  24.1 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  34.33 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  28.86 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  25 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  27.78 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 501 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>