More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  67.74 
 
 
900 aa  1058    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  66.15 
 
 
977 aa  1049    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
855 aa  1722    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.11 
 
 
759 aa  351  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.53 
 
 
735 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31 
 
 
740 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.51 
 
 
761 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.61 
 
 
750 aa  331  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.21 
 
 
750 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.51 
 
 
989 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 
762 aa  306  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.67 
 
 
856 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.5 
 
 
759 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.5 
 
 
759 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.39 
 
 
754 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.26 
 
 
754 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.79 
 
 
752 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.99 
 
 
754 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.99 
 
 
754 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.86 
 
 
754 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.86 
 
 
754 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.86 
 
 
754 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.99 
 
 
754 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  28.25 
 
 
849 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.2 
 
 
754 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.99 
 
 
759 aa  284  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  29.5 
 
 
748 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.37 
 
 
763 aa  282  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.69 
 
 
755 aa  281  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.01 
 
 
995 aa  280  6e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
756 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.08 
 
 
856 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.14 
 
 
991 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.35 
 
 
785 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.35 
 
 
785 aa  271  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  27.99 
 
 
734 aa  269  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  28.86 
 
 
843 aa  266  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.24 
 
 
991 aa  263  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 
995 aa  262  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.99 
 
 
990 aa  260  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.67 
 
 
848 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  31.11 
 
 
1001 aa  253  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  28.31 
 
 
1029 aa  251  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.11 
 
 
981 aa  248  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.6 
 
 
849 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.65 
 
 
853 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  33.04 
 
 
403 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  26.47 
 
 
793 aa  243  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.69 
 
 
487 aa  240  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.17 
 
 
1055 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.69 
 
 
846 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.35 
 
 
885 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.69 
 
 
834 aa  238  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.81 
 
 
846 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.65 
 
 
844 aa  234  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.65 
 
 
845 aa  233  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.55 
 
 
839 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.55 
 
 
844 aa  231  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.93 
 
 
844 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.99 
 
 
996 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.11 
 
 
753 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  38.57 
 
 
414 aa  224  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  32.63 
 
 
410 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  31.09 
 
 
411 aa  218  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  34.41 
 
 
411 aa  212  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  32 
 
 
423 aa  212  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 
464 aa  208  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.59 
 
 
532 aa  207  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  31.03 
 
 
413 aa  207  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  37.9 
 
 
347 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 
533 aa  206  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  31.09 
 
 
419 aa  205  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30.07 
 
 
406 aa  205  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.57 
 
 
461 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  30.11 
 
 
515 aa  204  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  31.09 
 
 
419 aa  203  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  30.42 
 
 
403 aa  202  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  33.88 
 
 
533 aa  201  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  30.24 
 
 
468 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 
531 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  30.91 
 
 
585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.93 
 
 
533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  31.91 
 
 
472 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  31.52 
 
 
533 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 
524 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  40.07 
 
 
412 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  40.39 
 
 
417 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.5 
 
 
534 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  29.66 
 
 
399 aa  197  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 
533 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  33.24 
 
 
366 aa  197  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  30.81 
 
 
594 aa  197  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  30.81 
 
 
594 aa  197  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  31.83 
 
 
470 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  31.83 
 
 
470 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  29.65 
 
 
461 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  29.63 
 
 
415 aa  196  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 
474 aa  194  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  40.78 
 
 
398 aa  194  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  36.96 
 
 
390 aa  194  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>