235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3724 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  100 
 
 		 312 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.28 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.44 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  25.29 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.96 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.6 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.6 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.6 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.17 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.29 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.31 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  26.48 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  26.48 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  25.61 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 401 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  25.55 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  27.73 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.35 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  25.48 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  26.51 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  26.1 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  26.02 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  26.02 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.9 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.32 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 		 376 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28.21 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  26.99 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  27.35 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  27.35 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.27 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.27 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.27 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  26.58 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.27 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  27.61 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  27.61 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  28.5 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  30 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  26.99 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  25.11 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  26.99 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.31 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  26.88 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  26.88 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.81 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  29.78 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  28.78 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  28.78 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  28.28 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.19 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  26.62 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  28 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  26.62 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  27.78 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  26.59 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  25.32 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.62 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  24.5 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  26.62 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  25.66 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.64 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  25.56 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  29.03 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  23.32 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  25.98 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.43 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  25.3 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  29.86 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  27.66 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.41 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  25.86 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  25.25 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  24.31 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  24.73 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.09 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  29.14 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  25.93 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  24.31 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.49 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  22.17 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.82 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  29.14 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  26.09 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.89 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  25.79 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  27.86 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.68 
 
 		 626 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>