242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2768 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2768  VCBS  100 
 
 		 183 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.67 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  43.78 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.43 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.46 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.35 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.43 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  44.26 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.88 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.56 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.14 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  41.71 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  41.24 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.31 
 
 		 172 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  42.37 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.48 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.93 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  37.08 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  38.86 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  39.33 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  36.52 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  37.14 
 
 		 409 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  40.22 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.76 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  38.8 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  36.16 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.57 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.53 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.16 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  34.16 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  34.16 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.89 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.55 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.44 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  28 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.66 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.33 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.39 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 		 176 aa  87.8  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.7 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.11 
 
 		 213 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  26.67 
 
 		 227 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.78 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.38 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.38 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  29.31 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.48 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.53 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  29.21 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.44 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  30.36 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.99 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  31.41 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  29.55 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.16 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.07 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.13 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  28.9 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  30.13 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  29.11 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  24.28 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  26.78 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.31 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.31 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.01 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  27.11 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  28.07 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.32 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.03 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.29 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  24.39 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.51 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.17 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  25.42 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.74 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>