153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2049 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 14609 aa  29530    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  23.62 
 
 		 14944 aa  340  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.78 
 
 		 12684 aa  308  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  34.11 
 
 		 1394 aa  226  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  28.11 
 
 		 776 aa  141  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  25.24 
 
 		 1207 aa  134  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.21 
 
 		 837 aa  132  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  25.72 
 
 		 1187 aa  125  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  41.71 
 
 		 462 aa  118  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  28.32 
 
 		 778 aa  118  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.96 
 
 		 792 aa  117  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  32.2 
 
 		 389 aa  116  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.27 
 
 		 1222 aa  115  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.27 
 
 		 784 aa  113  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  43.12 
 
 		 1831 aa  110  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  40.91 
 
 		 2452 aa  105  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  38.01 
 
 		 624 aa  102  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.15 
 
 		 553 aa  100  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.87 
 
 		 692 aa  99.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  23.65 
 
 		 1219 aa  94.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  49.54 
 
 		 1332 aa  94.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.64 
 
 		 941 aa  93.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1316 aa  92.4  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.87 
 
 		 1480 aa  89.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.68 
 
 		 1188 aa  89  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  42.14 
 
 		 1487 aa  87.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1908 aa  88.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.63 
 
 		 817 aa  87  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  45.93 
 
 		 474 aa  87  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.16 
 
 		 787 aa  85.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 745 aa  83.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  29.7 
 
 		 376 aa  83.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  43.06 
 
 		 767 aa  81.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.17 
 
 		 1096 aa  80.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.63 
 
 		 921 aa  77.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.89 
 
 		 535 aa  77  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 454 aa  76.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.38 
 
 		 2074 aa  76.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  24 
 
 		 1047 aa  75.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 447 aa  75.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  26.42 
 
 		 602 aa  75.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 		 658 aa  75.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.5 
 
 		 1147 aa  75.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  38 
 
 		 4009 aa  75.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  36.09 
 
 		 3907 aa  73.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  35.86 
 
 		 606 aa  72  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  38.04 
 
 		 823 aa  72  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  27.99 
 
 		 743 aa  71.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 449 aa  71.6  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  33.97 
 
 		 4022 aa  71.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  30.04 
 
 		 544 aa  71.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  50 
 
 		 654 aa  70.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.87 
 
 		 810 aa  69.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  37.95 
 
 		 307 aa  69.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  35.92 
 
 		 3861 aa  69.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  36.84 
 
 		 1362 aa  68.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.48 
 
 		 4357 aa  68.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  22.2 
 
 		 675 aa  68.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  52.86 
 
 		 3027 aa  66.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  51.52 
 
 		 830 aa  66.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.18 
 
 		 554 aa  66.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  25.09 
 
 		 638 aa  66.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  29.04 
 
 		 593 aa  65.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 396 aa  63.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  23.51 
 
 		 482 aa  63.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  37.38 
 
 		 286 aa  63.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.33 
 
 		 618 aa  62.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  26.32 
 
 		 575 aa  62.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  25.5 
 
 		 726 aa  62  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.41 
 
 		 561 aa  61.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  40.38 
 
 		 3822 aa  61.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.4 
 
 		 2117 aa  60.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  31.78 
 
 		 2096 aa  60.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1107 aa  60.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.77 
 
 		 1919 aa  59.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  55.84 
 
 		 2374 aa  58.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.85 
 
 		 900 aa  57.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.05 
 
 		 326 aa  57.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  27.21 
 
 		 1285 aa  58.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.32 
 
 		 706 aa  57.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.76 
 
 		 1123 aa  56.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  26.06 
 
 		 546 aa  56.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  26.6 
 
 		 298 aa  56.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  41.89 
 
 		 4231 aa  56.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  61.36 
 
 		 476 aa  55.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 827 aa  55.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 496 aa  55.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  42.44 
 
 		 640 aa  55.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.61 
 
 		 1152 aa  55.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  53.33 
 
 		 593 aa  55.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 491 aa  55.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 		 626 aa  54.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.9 
 
 		 626 aa  55.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  28.87 
 
 		 1695 aa  54.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 403 aa  54.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  23.29 
 
 		 260 aa  54.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.63 
 
 		 1143 aa  53.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25.82 
 
 		 1141 aa  54.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  32.71 
 
 		 499 aa  54.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  34.68 
 
 		 1051 aa  54.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>