More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2827 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  94.88 
 
 
410 aa  787    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  97.07 
 
 
410 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  100 
 
 
410 aa  846    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  97.8 
 
 
410 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  43.95 
 
 
580 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  41.45 
 
 
398 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.85 
 
 
483 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.66 
 
 
504 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  34.83 
 
 
507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.14 
 
 
5698 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  31.49 
 
 
345 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  36.92 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  36.62 
 
 
513 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  30.9 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  36.31 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  36.31 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  29.74 
 
 
345 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  29.86 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  31.4 
 
 
345 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  29.74 
 
 
345 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  29.74 
 
 
374 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  29.45 
 
 
374 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  31.37 
 
 
389 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  29.45 
 
 
345 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  35.61 
 
 
285 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28 
 
 
405 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  35.64 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.52 
 
 
559 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.21 
 
 
391 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  29.66 
 
 
494 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  28.97 
 
 
555 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.35 
 
 
365 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.89 
 
 
600 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.54 
 
 
367 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  29.12 
 
 
715 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.57 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.29 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.15 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.32 
 
 
450 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.83 
 
 
669 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.86 
 
 
601 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  23.55 
 
 
675 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.3 
 
 
498 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.48 
 
 
520 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.7 
 
 
497 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.94 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.94 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.36 
 
 
483 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.94 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  29.07 
 
 
616 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.97 
 
 
677 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.99 
 
 
674 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.64 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.94 
 
 
490 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.97 
 
 
635 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.94 
 
 
483 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.67 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.64 
 
 
463 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  28.65 
 
 
778 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.55 
 
 
658 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  26.63 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  25.53 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.75 
 
 
544 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.35 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.96 
 
 
578 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  22.81 
 
 
610 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.92 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.64 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.1 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.86 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.64 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  26.25 
 
 
695 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.03 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.66 
 
 
650 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.93 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.69 
 
 
633 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  25.79 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  27.65 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.77 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.11 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.54 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.38 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  24.44 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  24.47 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.78 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.94 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  24.15 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  25.95 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.58 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  26.93 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.65 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.66 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.07 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  27.9 
 
 
491 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.49 
 
 
681 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  25.08 
 
 
502 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.3 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.3 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.93 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>