217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0799 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  100 
 
 
351 aa  728    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  39.47 
 
 
358 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
320 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  36.33 
 
 
331 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  34.85 
 
 
339 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  40.6 
 
 
340 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  33.82 
 
 
326 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  35.49 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
339 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  28.03 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  36.79 
 
 
297 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
317 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
326 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  34.35 
 
 
330 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
336 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
336 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
326 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  32.24 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
331 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
336 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
372 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  34.78 
 
 
345 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  34.48 
 
 
354 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.68 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.57 
 
 
350 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.21 
 
 
339 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
350 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.8 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.11 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.02 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.22 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.46 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.85 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25 
 
 
341 aa  86.3  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  30.11 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.74 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.38 
 
 
629 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.72 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.9 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  23.59 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  25.36 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  24.07 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.5 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.03 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  22.59 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  23.69 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  23.25 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.7 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  22.05 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  24.42 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  24.22 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  23 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.23 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.66 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.33 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>