79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0585 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  48.71 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  35.34 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.97 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.05 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.28 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  33.42 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.84 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.54 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  29.59 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.69 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  27.53 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  29.16 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.1 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.87 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  29.21 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  27.01 
 
 		 481 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.49 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.25 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.54 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  31 
 
 		 526 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  26.95 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>