More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2343 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.95 
 
 		 1048 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  75.02 
 
 		 1026 aa  1478    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  74.09 
 
 		 1022 aa  1484    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  73.11 
 
 		 1026 aa  1481    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  74.39 
 
 		 1022 aa  1492    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  74.05 
 
 		 1030 aa  1485    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  40.18 
 
 		 1029 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.78 
 
 		 1039 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  74.39 
 
 		 1022 aa  1493    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  72.83 
 
 		 1025 aa  1464    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  73.52 
 
 		 1023 aa  1509    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1037 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  74.75 
 
 		 1026 aa  1499    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  74.85 
 
 		 1026 aa  1502    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  72.77 
 
 		 1021 aa  1507    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  72.7 
 
 		 1023 aa  1499    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  39.94 
 
 		 1049 aa  728    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  72.28 
 
 		 1038 aa  1433    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  75.54 
 
 		 1026 aa  1512    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  74.29 
 
 		 1022 aa  1489    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1022 aa  2048    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  41.18 
 
 		 830 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1019 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1008 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1022 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.97 
 
 		 1028 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.1 
 
 		 1027 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1012 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.47 
 
 		 1019 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.98 
 
 		 1019 aa  363  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1020 aa  363  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1046 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.06 
 
 		 1016 aa  357  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.97 
 
 		 1010 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1019 aa  354  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1041 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.57 
 
 		 1025 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1021 aa  350  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.47 
 
 		 1025 aa  350  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1019 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1035 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1021 aa  346  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1030 aa  346  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1021 aa  346  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1009 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1014 aa  346  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28 
 
 		 1025 aa  344  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1021 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1044 aa  340  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1029 aa  340  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1029 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1057 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  28.05 
 
 		 1015 aa  339  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1027 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1029 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1046 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1051 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1029 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1056 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1053 aa  335  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1059 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1027 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1026 aa  334  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  24.95 
 
 		 1046 aa  334  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1054 aa  333  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1046 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  25.67 
 
 		 1022 aa  331  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1029 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1027 aa  330  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1024 aa  330  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1016 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1029 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1028 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1031 aa  329  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1023 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1009 aa  329  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1029 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.69 
 
 		 1014 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1035 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1035 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1041 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1022 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1048 aa  327  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1029 aa  327  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1020 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  25.39 
 
 		 1020 aa  326  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  25.27 
 
 		 1025 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  25.4 
 
 		 1020 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1021 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1047 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.17 
 
 		 1032 aa  324  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1040 aa  324  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1047 aa  324  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1014 aa  324  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1047 aa  323  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1036 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1021 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1048 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>