More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0976 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
515 aa  1042    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  38.31 
 
 
514 aa  333  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.91 
 
 
531 aa  253  7e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.29 
 
 
518 aa  247  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.86 
 
 
532 aa  246  6e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  43.03 
 
 
528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.63 
 
 
517 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  38.74 
 
 
536 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.43 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  38.64 
 
 
537 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  36.87 
 
 
536 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  38.63 
 
 
542 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  36.12 
 
 
562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.93 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  31.95 
 
 
531 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.54 
 
 
530 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.54 
 
 
528 aa  230  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  47.9 
 
 
551 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
530 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  39.14 
 
 
548 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  39.35 
 
 
556 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.22 
 
 
536 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  33.53 
 
 
530 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 
542 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.67 
 
 
567 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  42.47 
 
 
539 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  34.86 
 
 
545 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  35.31 
 
 
557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 
541 aa  219  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  40.43 
 
 
547 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
581 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  40.28 
 
 
552 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  43.64 
 
 
541 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.56 
 
 
552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  46.61 
 
 
541 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.56 
 
 
552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  39.49 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  46.61 
 
 
541 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  46.61 
 
 
541 aa  217  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 
560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
553 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 
560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  46.61 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.6 
 
 
578 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.06 
 
 
557 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  46.22 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
555 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  40.26 
 
 
544 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.57 
 
 
554 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.6 
 
 
578 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.57 
 
 
554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  43.72 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.88 
 
 
557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.94 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  46.22 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  39.01 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  45.82 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  35.81 
 
 
550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  45.82 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  45.82 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  29.48 
 
 
542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  37.75 
 
 
562 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  46.12 
 
 
571 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  47.06 
 
 
557 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.29 
 
 
563 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.06 
 
 
553 aa  213  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.09 
 
 
541 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  45.23 
 
 
542 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.43 
 
 
536 aa  212  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.2 
 
 
555 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  47.57 
 
 
570 aa  211  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  47.7 
 
 
552 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  30.27 
 
 
545 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 
541 aa  210  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  44.94 
 
 
540 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  39.68 
 
 
534 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.44 
 
 
555 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.08 
 
 
554 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.08 
 
 
554 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  39.61 
 
 
544 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  44.17 
 
 
569 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.87 
 
 
550 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.71 
 
 
550 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  44.66 
 
 
559 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
533 aa  208  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.58 
 
 
545 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.83 
 
 
546 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.14 
 
 
540 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  45 
 
 
543 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>