More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0548 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  61.51 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  61.25 
 
 		 257 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  60 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  58.44 
 
 		 261 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.8 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.92 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  47.92 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.81 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  42.91 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.27 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.9 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  49.54 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.7 
 
 		 245 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.78 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.41 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  40.64 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.41 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.46 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  41.18 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  45.85 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  42.58 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  42.56 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  47.32 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  46.26 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.67 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.77 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  48.17 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.13 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  45.09 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  45.21 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  40.42 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.98 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.58 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.17 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.42 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  42.75 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  40.8 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  40.4 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  44.44 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  43.2 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  44.39 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.67 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  46.58 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  41.84 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  40.94 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  41.57 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  39 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  43.1 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.35 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  39.53 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  37.08 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.97 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.1 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  41 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  38.43 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  39.53 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  43.81 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  44.08 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  45.78 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.16 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  43.95 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.78 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  39.27 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.66 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  41.77 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.74 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  46.09 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  37.7 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.32 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>