More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0741 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  98.72 
 
 		 313 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 356 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.74 
 
 		 334 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.26 
 
 		 688 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.38 
 
 		 727 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.97 
 
 		 727 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.13 
 
 		 732 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.74 
 
 		 727 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6248  two component LuxR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.713882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1191 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  46.84 
 
 		 692 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  38.35 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 929 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 571 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 662 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 725 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 601 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 409 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 713 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 489 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 713 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.32 
 
 		 872 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.4 
 
 		 717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  33.98 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 1153 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  33.98 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.84 
 
 		 583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 759 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  41.18 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 588 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 		 687 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 826 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.1 
 
 		 1190 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 897 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 707 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 		 1057 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 850 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 840 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 814 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 742 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 1370 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 930 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  35.75 
 
 		 728 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1076 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 728 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.57 
 
 		 1170 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 550 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  32.6 
 
 		 478 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 957 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.57 
 
 		 1170 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1068 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.49 
 
 		 1027 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  34.74 
 
 		 930 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 934 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 951 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 677 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 488 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1086 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 705 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 		 695 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 512 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 489 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  35.55 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 1001 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 1225 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  39.39 
 
 		 1225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  34.78 
 
 		 1086 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  41.26 
 
 		 1202 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1092 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>