138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3950 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  87.55 
 
 		 261 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  33.19 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32.35 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  30.8 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  33.33 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  33.06 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  33.19 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  29.75 
 
 		 270 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  29.75 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  32.93 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.49 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  31.82 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.99 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.66 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  35.22 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.27 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  29.32 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  39.72 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  39.72 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.81 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  39.01 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  35.22 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  30.04 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  28.98 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  28.1 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  32.91 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.13 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.81 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.98 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.1 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.94 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.19 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  37.1 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  34.38 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.67 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  32.99 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.79 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.54 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  32.33 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  28.76 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  33.61 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  35.82 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.84 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  30.04 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  34.81 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  33.87 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.65 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.05 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.04 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.26 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  29 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  33.06 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.2 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  32.59 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  33.33 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  27.8 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  34.85 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  33.83 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.03 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  33.83 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  32.26 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  33.06 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  27.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  34.56 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.03 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 350 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  30.09 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25.6 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  24.69 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  31.06 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  33.08 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  36.63 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  34.58 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.82 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  27.47 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  27.91 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.32 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  21.43 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  26.11 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  31.25 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  31.85 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  24.35 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  25.97 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  29.69 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  32.06 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  22.94 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  27.22 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  27.22 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>