More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2364 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 646 aa  1283    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.79 
 
 		 644 aa  805    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 794 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 844 aa  178  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 801 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 1168 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.34 
 
 		 952 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 711 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  44.81 
 
 		 600 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  41.18 
 
 		 592 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 592 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 842 aa  160  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  40.68 
 
 		 1092 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 804 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1139 aa  157  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.35 
 
 		 1255 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  40.74 
 
 		 552 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 544 aa  157  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  38.98 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0319  histidine kinase  37.62 
 
 		 707 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39.3 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0308  histidine kinase  37.62 
 
 		 707 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1509 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 407 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.38 
 
 		 819 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 852 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 852 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1262 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  37.5 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.6 
 
 		 823 aa  153  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  37.04 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  36.5 
 
 		 737 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  35.56 
 
 		 1258 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 542 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  39.75 
 
 		 560 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1745  ATP-binding region ATPase domain protein  38.06 
 
 		 270 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 571 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 407 aa  150  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.54 
 
 		 1258 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.77 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1418 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 970 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 991 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 1109 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  39.75 
 
 		 542 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 822 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 850 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  38.08 
 
 		 457 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.13 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 919 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  41.84 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 717 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 645 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 713 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 394 aa  147  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  38.59 
 
 		 647 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 584 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 703 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 557 aa  147  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1108 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 862 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 586 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 814 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1194 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 793 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 689 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 523 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 689 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  40.96 
 
 		 1278 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 394 aa  144  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  37.29 
 
 		 1561 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1275 aa  144  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1432 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 857 aa  144  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 523 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 803 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  38.55 
 
 		 527 aa  144  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 953 aa  143  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  37.4 
 
 		 594 aa  143  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.81 
 
 		 505 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  37.25 
 
 		 584 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.58 
 
 		 541 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 847 aa  143  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1113 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 1021 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>