108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2252 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  42.99 
 
 		 1266 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  67.79 
 
 		 1265 aa  1702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  43.43 
 
 		 1548 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  46.59 
 
 		 1259 aa  935    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  45.25 
 
 		 1471 aa  794    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  100 
 
 		 1267 aa  2541    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  46.31 
 
 		 1297 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  46.5 
 
 		 1315 aa  893    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  46.31 
 
 		 1297 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  43.07 
 
 		 1574 aa  747    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  43.35 
 
 		 1544 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  43.47 
 
 		 1574 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  43.07 
 
 		 1580 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  45.7 
 
 		 1313 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  46.23 
 
 		 1297 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  46.85 
 
 		 1315 aa  904    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  28.13 
 
 		 1230 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1271 aa  313  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  27.18 
 
 		 1172 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  25.44 
 
 		 1309 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  37.71 
 
 		 1244 aa  247  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  28.51 
 
 		 1157 aa  232  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  28.45 
 
 		 1159 aa  228  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  27.72 
 
 		 1588 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1160 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  33.25 
 
 		 1542 aa  218  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  29.85 
 
 		 1157 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  27.11 
 
 		 1569 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  28.51 
 
 		 1164 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  34.42 
 
 		 1157 aa  214  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  34.59 
 
 		 1157 aa  214  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  34.42 
 
 		 1140 aa  214  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  34.59 
 
 		 1157 aa  214  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1157 aa  214  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  34.42 
 
 		 1157 aa  214  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1180 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1150 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1172 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1150 aa  207  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1180 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  28.87 
 
 		 1172 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  25.47 
 
 		 1186 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  33.77 
 
 		 1367 aa  179  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  35.49 
 
 		 289 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  24.55 
 
 		 1331 aa  162  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  32.2 
 
 		 1324 aa  156  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.68 
 
 		 729 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  21.21 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.83 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 878 aa  58.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.32 
 
 		 935 aa  57.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 883 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.7 
 
 		 1213 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 637 aa  54.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.95 
 
 		 725 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 221 aa  53.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 639 aa  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 611 aa  52  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 635 aa  51.6  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 635 aa  51.6  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 485 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  22.54 
 
 		 420 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  22.54 
 
 		 420 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  29.36 
 
 		 614 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  23.5 
 
 		 420 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 420 aa  49.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 612 aa  49.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  20.67 
 
 		 748 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  23.24 
 
 		 420 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  28.09 
 
 		 321 aa  48.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.8 
 
 		 626 aa  48.5  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  23.24 
 
 		 420 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 420 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.59 
 
 		 2401 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 626 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 		 1979 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 626 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  26.56 
 
 		 451 aa  48.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 280 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 636 aa  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 614 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 614 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 614 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 614 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 614 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.3 
 
 		 884 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 828 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  26.64 
 
 		 520 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 612 aa  47.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  22.83 
 
 		 420 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 632 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.94 
 
 		 584 aa  47  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.04 
 
 		 739 aa  46.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 505 aa  46.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1138 aa  46.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  22.82 
 
 		 1098 aa  46.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 330 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 542 aa  46.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 615 aa  46.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>