More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2226 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  71.23 
 
 		 281 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 290 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.69 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  30.28 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.41 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  27.05 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1617  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>