76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6542 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 448 aa  918    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  97.32 
 
 		 448 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  31.26 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.21 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.43 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.93 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.28 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  19.61 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  18.34 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  19.07 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 452 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 424 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.86 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  19.84 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  21.73 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  20.49 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  20.42 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  20.84 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.59 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  20.69 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.28 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 473 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>