More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5174 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  292  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  67.38 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  64.29 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  58.62 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  60.28 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  59.57 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.43 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30.61 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  28.78 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.99 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  29.5 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  31.25 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  49.12 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.51 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  52.08 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  31.58 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.58 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.41 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  47.27 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40.7 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.67 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.97 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  38.04 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.71 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.17 
 
 		 302 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  34.94 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32.67 
 
 		 200 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.64 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.58 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.72 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  36.17 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  27.86 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.07 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.43 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  27.93 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  48 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.01 
 
 		 168 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.26 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.66 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  26.49 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.62 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.89 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  26.9 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  25.18 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  48.98 
 
 		 515 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.86 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  29.03 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>