More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4961 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  82.3 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  63.6 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  57.72 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  45.98 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  45.98 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  44.86 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  45.45 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  43.24 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 272 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 272 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  41.55 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  42.48 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  35.9 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  31.56 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  33.01 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  33.5 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  34.45 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  33.97 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  32.04 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  34.39 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.86 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.44 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  23.46 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  27.9 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.28 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  29.62 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  39.01 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>