85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1828 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 529 aa  1011    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  82.7 
 
 		 526 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  42.57 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  40.59 
 
 		 541 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  32.87 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.91 
 
 		 476 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 		 486 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  32.78 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 426 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 436 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  27.75 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  21.99 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 483 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 899 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 446 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  21.83 
 
 		 422 aa  50.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 449 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 503 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.03 
 
 		 517 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 		 491 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  30.58 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.3 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.1 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.6 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  29.14 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 419 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  17.24 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  20.22 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  30.99 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 468 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.43 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0050  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 516 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  19.78 
 
 		 471 aa  43.5  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 488 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>