More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0624 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  100 
 
 		 370 aa  752    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  78.51 
 
 		 364 aa  589  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  35.78 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.11 
 
 		 582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  31.91 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  33.23 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  30.56 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.79 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.37 
 
 		 566 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  30.89 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.75 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.57 
 
 		 452 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  30.46 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.57 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  30.24 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.62 
 
 		 271 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  33 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  29.32 
 
 		 717 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.34 
 
 		 793 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.25 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  28.07 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  28.98 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.26 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.84 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  28.8 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  30.19 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.06 
 
 		 966 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.43 
 
 		 574 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  29.5 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.11 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  25.74 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  29.41 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  26.53 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  29.71 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31.6 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  31.15 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  31.07 
 
 		 375 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  29.78 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  27.49 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.74 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  31 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  31 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.63 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.53 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  31 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.43 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.29 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.95 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.64 
 
 		 792 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.51 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  30.98 
 
 		 785 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.16 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  27.1 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  34.78 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  31.65 
 
 		 270 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  28.34 
 
 		 270 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  29.27 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  27.06 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.21 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  26.18 
 
 		 468 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  32.28 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  27.32 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  27.32 
 
 		 406 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  26.89 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  25.59 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  28.71 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  29.07 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  31.17 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.46 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  26.65 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  30 
 
 		 796 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  30 
 
 		 796 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.28 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.24 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  25.52 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  26.95 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  30.23 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  26.12 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  32.51 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.04 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  28.31 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.46 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  27.64 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.94 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  26.95 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.96 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  30.73 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.29 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  29.18 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  28.12 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  30.03 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.94 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  28.35 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  28.5 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  29.43 
 
 		 790 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.24 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  27.51 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.14 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  29.52 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  26.29 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>