202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0891 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0891  putative lipoprotein  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.363654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2550  VacJ family lipoprotein  98.85 
 
 
262 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0116  VacJ family lipoprotein  87.4 
 
 
261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211994  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0140  VacJ family lipoprotein  50 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2480  VacJ-like lipoprotein  49.36 
 
 
266 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.0468041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  43.58 
 
 
241 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  41.62 
 
 
352 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 
336 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  38.3 
 
 
249 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  39.91 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  36.12 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  40.4 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_003296  RS01688  lipoprotein  37.31 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  38.81 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  39.9 
 
 
245 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  38.28 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  35.8 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  36.16 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 
350 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  34.8 
 
 
252 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  35.17 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.24 
 
 
267 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  37.1 
 
 
261 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  40.36 
 
 
250 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  40.38 
 
 
250 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  34.76 
 
 
261 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  34.02 
 
 
249 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  35.62 
 
 
232 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  36 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  34.45 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  34.45 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  36.64 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  36.84 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  35.84 
 
 
233 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  37.5 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  38.54 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  35.56 
 
 
338 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  34.96 
 
 
315 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  40.76 
 
 
260 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  35.84 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0220  VacJ family lipoprotein  32.73 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  35.09 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  35.24 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 
235 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  33.48 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  37.56 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  36.67 
 
 
266 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  34.65 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  36.02 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  35.06 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  35.59 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  47.06 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  37.17 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  33.19 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  40.19 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  46.72 
 
 
257 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.59 
 
 
229 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 
220 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  34.82 
 
 
319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  34.82 
 
 
336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  35.32 
 
 
277 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 
251 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 
259 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  34.82 
 
 
336 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 
347 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  31.92 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  34.67 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  34.36 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  33.07 
 
 
256 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  35.07 
 
 
347 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 
347 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  34.36 
 
 
342 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  34.36 
 
 
310 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  34.06 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  36.27 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  33.48 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  36.51 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  32.77 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  36.15 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  34.38 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  34.6 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  36.15 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  36.27 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  32.22 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  34.38 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  36.36 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  34.27 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  34.38 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  34.38 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  34.53 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  33.19 
 
 
340 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
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NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  34.76 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  33.8 
 
 
320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal 
 
 
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NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  33.8 
 
 
320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
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