299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4195 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 162 aa  322  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  87.04 
 
 		 169 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  78.4 
 
 		 162 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  75.47 
 
 		 193 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  73.75 
 
 		 168 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  70.44 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  71.07 
 
 		 162 aa  222  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  52.74 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  52.74 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  46.62 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.09 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  37.35 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 301 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  31.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 304 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.38 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.78 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  35.34 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  34.43 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.71 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 542 aa  47.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  48.28 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  36.67 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  28.91 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  44.44 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.23 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  49.02 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.33 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>