More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2165 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 390 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  71.91 
 
 		 395 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  68.75 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  64.95 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  64.69 
 
 		 396 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  64.77 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  65.36 
 
 		 393 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  32.67 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  35.06 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.81 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  31.05 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.52 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.85 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  33.46 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3260  hypothetical protein  25.67 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.7 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 379 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.9 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.76 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.03 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  22.38 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.87 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 339 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0192  hypothetical protein  26.39 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.681892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>