More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2647 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
397 aa  815    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  36.44 
 
 
364 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 
394 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 
396 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 
396 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
390 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 
397 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 
397 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3260  hypothetical protein  31.67 
 
 
424 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0192  hypothetical protein  31.77 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.681892  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
404 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
401 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
400 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.22 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
400 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
392 aa  113  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
406 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
394 aa  106  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
397 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
412 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
399 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
395 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
396 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
405 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.3 
 
 
395 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
381 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
385 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
377 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
394 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.27 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.47 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.25 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  23.99 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1908  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  22.44 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.55 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.67 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.91 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.12 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  22.61 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.6 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.82 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.82 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  23.25 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.63 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  22.66 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>