More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1770 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  98.29 
 
 
410 aa  820    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  96.15 
 
 
410 aa  767    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
410 aa  830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  63.41 
 
 
407 aa  521  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  61.76 
 
 
410 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  52.23 
 
 
399 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  54.57 
 
 
400 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.48 
 
 
405 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  52.99 
 
 
405 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  51.38 
 
 
404 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  52.69 
 
 
412 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  51.55 
 
 
402 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
403 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  51.28 
 
 
392 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  53 
 
 
406 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  51.28 
 
 
394 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  44.07 
 
 
415 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  44.03 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  38.28 
 
 
416 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  37.34 
 
 
417 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  36.45 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  36.79 
 
 
412 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 
396 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 
396 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 
379 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.2 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
397 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 
379 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  29.46 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.85 
 
 
391 aa  110  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.94 
 
 
371 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 
460 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 
383 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
379 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
388 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
373 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
372 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.91 
 
 
380 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
383 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.27 
 
 
380 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
379 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
376 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.53 
 
 
373 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
372 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
380 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
405 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
391 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
380 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
391 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.54 
 
 
399 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.85 
 
 
393 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
372 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
372 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
372 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
372 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
419 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
386 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
376 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  28.27 
 
 
368 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 
368 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  29.18 
 
 
371 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  29.18 
 
 
371 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  29.18 
 
 
371 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
372 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.81 
 
 
376 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
380 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.54 
 
 
380 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
374 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
371 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
381 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  27.95 
 
 
373 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>