More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0402 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 596 aa  1197    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  45.48 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 878 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.03 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 750 aa  98.6  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.64 
 
 		 1694 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 1737 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 512 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1276 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 739 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 927 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.64 
 
 		 865 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.04 
 
 		 784 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.9 
 
 		 632 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.68 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.41 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 685 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.05 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25 
 
 		 887 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.11 
 
 		 764 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.74 
 
 		 314 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.85 
 
 		 620 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.51 
 
 		 573 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.75 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1094 aa  77.8  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 909 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 620 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 3560 aa  77  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 3145 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.4 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.23 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 4079 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.95 
 
 		 730 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1192 aa  74.3  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 3172 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 583 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.24 
 
 		 603 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.78 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 804 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 750 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 612 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.29 
 
 		 1007 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  27.09 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.89 
 
 		 832 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 		 979 aa  70.5  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 409 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3035 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 711 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 280 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 		 2240 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.19 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 955 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.82 
 
 		 820 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1827 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 3301 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.23 
 
 		 745 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.09 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  29.37 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 824 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 614 aa  67  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.26 
 
 		 715 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.36 
 
 		 706 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 614 aa  67  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 614 aa  67  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>