More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1310 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  72.86 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  70.05 
 
 		 217 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  68.57 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  67.46 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  63.64 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  60.56 
 
 		 222 aa  264  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.96 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.93 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  46.45 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.12 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  44.29 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.13 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.02 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  45.5 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.31 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.66 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.46 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.9 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  44.13 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.62 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.73 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.56 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.79 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.83 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.51 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.03 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  40.76 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.59 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.71 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  39.35 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.03 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 688 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.72 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  39.01 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.47 
 
 		 901 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  43 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  40.65 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  39.44 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 209 aa  147  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  43 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  39.62 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  44.09 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.21 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  39.71 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 707 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  40.65 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  44.27 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 686 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  42.49 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 705 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.1 
 
 		 703 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.76 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  40.47 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  41.05 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.15 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  44.09 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  38.71 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  41.8 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>