55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2940 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  47.6 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  43.84 
 
 
501 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  45.58 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  30.94 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  29.6 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.95 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  29.82 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  28.16 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.51 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.18 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.53 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 
451 aa  65.1  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.06 
 
 
451 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  29.58 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.51 
 
 
1444 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 
1505 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.69 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.27 
 
 
558 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.35 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  29.78 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
1140 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  22.57 
 
 
258 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
452 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.58 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  23.14 
 
 
1194 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  29.82 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  24.72 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.85 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 
453 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  24.06 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.88 
 
 
1145 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
440 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  24.22 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 
242 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  22.65 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  24.31 
 
 
322 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 
326 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  26.62 
 
 
1046 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  26.24 
 
 
455 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.83 
 
 
515 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  25.73 
 
 
276 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  23.08 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.88 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  24.55 
 
 
276 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>