70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1600 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 607 aa  1260    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3067  YD repeat protein  69.06 
 
 		 2003 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1602  hypothetical protein  68.8 
 
 		 753 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2663  hypothetical protein  50.81 
 
 		 702 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.638234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1036  AmoP  49.16 
 
 		 1882 aa  357  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678372  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.01 
 
 		 1599 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.53 
 
 		 1681 aa  68.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  30.17 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1935 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 2942 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1917 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1840 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  23.9 
 
 		 1464 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1600 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.96 
 
 		 1942 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  23.84 
 
 		 2658 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1409 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 2558 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.81 
 
 		 1576 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 867 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  29.21 
 
 		 1912 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  26.92 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 909 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.22 
 
 		 1485 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  29.32 
 
 		 1929 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.51 
 
 		 738 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 913 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.41 
 
 		 1008 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.41 
 
 		 1008 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1400 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1669 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  22.83 
 
 		 2554 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  23.18 
 
 		 1710 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 480 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1411 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1572 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  27.82 
 
 		 1957 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  23.33 
 
 		 2698 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  33.67 
 
 		 2277 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.83 
 
 		 903 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.24 
 
 		 1385 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3469  hypothetical protein  24.38 
 
 		 364 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  26 
 
 		 1991 aa  47.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1352 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1854 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.14 
 
 		 678 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1386 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  22.89 
 
 		 535 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  22.1 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22.45 
 
 		 869 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.39 
 
 		 2762 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.5 
 
 		 1345 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.1 
 
 		 2413 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  25.42 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.5 
 
 		 1345 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.83 
 
 		 2225 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.87 
 
 		 1348 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1770 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 414 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1467 aa  44.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  25.58 
 
 		 765 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  32.04 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  25.99 
 
 		 1938 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  25.19 
 
 		 2349 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.25 
 
 		 1732 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  37.31 
 
 		 1556 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>