More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0662 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 547 aa  1124    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 710 aa  279  8e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 		 433 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.53 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.85 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.8 
 
 		 441 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 410 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.84 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 		 452 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 446 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.1 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.1 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 		 430 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.98 
 
 		 439 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  35.59 
 
 		 430 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 428 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 438 aa  203  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.31 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  33.43 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.7 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 443 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 434 aa  201  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.16 
 
 		 426 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  33.85 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  37.83 
 
 		 435 aa  200  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.05 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 		 441 aa  199  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.2 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  36.76 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 		 461 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  35.83 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  36.14 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.72 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.52 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  36.93 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 		 437 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  37.2 
 
 		 457 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  36.61 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 483 aa  193  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  36.04 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 		 440 aa  191  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 446 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 		 440 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 415 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 481 aa  190  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  38.49 
 
 		 450 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  36.82 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  33.07 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  36.84 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.2 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.44 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.03 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.46 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  36.39 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  33.71 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 		 427 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.18 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 413 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 413 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  32.62 
 
 		 471 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 		 444 aa  187  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.27 
 
 		 428 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.24 
 
 		 434 aa  187  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  35.17 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  32.71 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 538 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>